「全國水環境改善計畫」即將推動第三批次計畫提報，除計畫範圍之水質改善與環境營造外，另一大重點為生態保育。目前依據行政院公共工程委員會於民國106年4月25日函頒之「公共工程生態檢核機制」，為減輕公共工程對生態環境造成的負面影響，秉持生態保育、公民參與及資訊公開之原則，以積極創造優質的環境，爰訂定本機制。中央政府各機關執行新建工程時，生態檢核於各工程生命週期(包含計畫提報、規劃設計、施工與維護管理)等作業階段，均需辦理生態檢核作業。
生態檢核機制融合生態保育、民眾參與及資訊公開，將環境友善與生態工法概念導入工程之生命週期，而棲地評估方法可在短時間內協助使用者篩選出重要環境控制變因，以掌握生態保育議題及核心問題，並進一步研擬策略及執行方案，且可協助瞭解棲地環境生態在水利工程施工前中後之變化。
為使第三河川局同仁們瞭解生態檢核作業與內容，爰委託逢甲大學於108年2月26日辦理生態檢核教育訓練，本次教育訓練內容包含四個類型(鄉村型、野溪型、河口型及都市型)實際案例分享、並前往沙鹿區南勢溪實地進行生態檢核演練，針對生態調查過程中需注意事項，藉由本次訓練能大大提升第三河川局同仁們專業知識並有助於未來相關計畫審查與工作執行。